基于生物信息学的青藤碱治疗类风湿关节炎作用机制研究

摘要

目的:通过分子反向对接和网络药理学预测青藤碱(SN)治疗类风湿关节炎(RA)的潜在靶点、通路,探究SN治疗RA的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)评估SN的可药性,将药物再定位及药物不良反应预测服务器(DRAR-CPI)预测出的SN潜在靶点与DisGeNET数据库中查询到的RA靶点作交集,以获取SN治疗RA的潜在靶点,利用GeneMANIA构建靶点间相互关系网络及筛选hub靶点,利用KOBAS 3.0和Omicshare平台工具等进行基因本体(GO)、京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:SN的理化性质表明其具有良好的可药性.预测出SN治疗RA的潜在靶点47个,相关潜在靶点间存在共表达特征、可预测到的相互作用关系等关联,并筛选出蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、硫氧还蛋白(TXN)3个hub靶点.GO富集结果涉及16个生物学过程、7个分子功能及10个细胞组件,KEGG显著富集通路的前10条通路包括细胞凋亡通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、低氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、Ras相关蛋白1(Rap1)信号通路等.结论:SN可能通过作用于AKT1、TP53、TXN、白细胞介素-10(IL-10)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等靶点及细胞凋亡、TNF信号通路、HIF-1信号通路、相关蛋白Rap1信号通路等通路影响RA的疾病过程,为后期相关实验验证及临床应用研究提供了数据支撑.