深圳地区环境水体和人群中诺如病毒监测与分析

摘要

[目的]检测深圳地区环境水体和人群的诺如病毒(NoVs),探讨其是否在两者之间循环传播.[方法]2014年3月至2015年2月检测24份深圳茅洲河河水标本和287份腹泻患者粪便标本.河水标本经过混合纤维素酯膜和PEG法二次浓缩后提取核酸,粪便标本无需浓缩,稀释离心后直接提取核酸.应用实时荧光逆转录PCR初步分型,RT-PCR扩增ORF2保守区域衣壳蛋白(VP1)基因后测序确定亚型、分析不同来源病毒的同源性;同时建立基因进化树,进一步分析不同来源NoVs的亲缘关系.[结果]在河水标本和腹泻患者粪便标本中,NoVs阳性率分别为23.1％和17.4％,其中上下游河水标本阳性率分别为8.3％和41.7％,河水中NoVGⅠ型和NoVGⅡ型的阳性率为16.7％和8.3％.扩增阳性样本发现茅洲河水中检出NoV主要是GⅠ.6型,其次是GⅡ.4 Sydney2012型,而从腹泻胃肠炎患者粪便标本中检出NoVs主要是NoVGⅡ.4Sydney_2012型和少量的GⅡ.3型.同时期水体和人群粪便标本来源的NoVGⅡ.4 Sydney_2012型VP1基因相似性98.2％-100.0％.[结论]NoVGⅡ.4 Sydney_2012型是深圳地区主要的流行株.NoVs在环境水体和人群中于某种程度上存在循环传播.