鼠疫耶尔森菌pgm位点及其侧翼序列遗传变异的比较分析

摘要

目的研究鼠疫耶尔森菌中国自然分离株pgm位点及其侧翼序列的变异,了解不同疫源地菌株间的毒力差异,为鼠疫防治提供帮助.方法比较分析现有4株菌的pgm位点及其侧翼序列的变异,采用PCR、等位基因特异性PCR扩增260株中国自然分离株和7株假结核耶尔森菌.结果除锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株外,其他菌株均缺失了YP1666的70～87bp之间的18bp碱基.1 406bp处T的缺失仅存在于东方型菌株中.北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株的pgm位点下游都没有IS100插入;锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株的色素沉着区有1个IS285插入,在其下游3kb区域还有1个IS100插入.冈底斯山型和昆仑山A、B型菌株的pgm位点上游侧翼区与其他菌株不同.36株菌的pgm位点缺失,缺失的菌株主要集中在鄂尔多斯高原型,松辽平原B型,昆仑山A、B型4种生态型菌株中.结论北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株是中国鼠疫耶尔森菌中比较古老的菌株.锡林郭勒高原型和青海田鼠型菌株是一个独特的分支,建议归为第4个生物型--田鼠型.北天山东段型及西段A、B型,锡林郭勒高原型,青海田鼠型菌株的pgm位点,由于在其下游没有IS100插入,所以稳定、不易缺失.pgm位点及其侧翼序列的变异与菌株的生物型、自然疫源地和生态型都具有一定的相关性.