Lnc RNA TUC338影响人类宫颈癌细胞的蛋白组学分析

摘要

目的探究长链非编码RNA TUC338影响人类宫颈癌细胞的分子机制。方法将人类宫颈癌细胞Hela细胞分为实验组(TUC338组)与对照组(rLV组),分别感染rLV-hTUC338-ZsGreen-Puro慢病毒及rLV-ZsGreen-Puro慢病毒,RT-PCR检测两组细胞Lnc RNA TUC338表达量,并对两组细胞进行蛋白质谱分析。结果感染慢病毒后所有细胞均有绿色荧光显示,RT-PCR结果显示TUC338组Lnc RNA TUC338表达量较rLV组增加,两组均显示较多的蛋白条带;非标记定量法蛋白测序共检测到4323个蛋白。蛋白差异分析显示:与rLV组比较,在TUC338组中下调的蛋白有194个,上调的蛋白有225个。其中,重要的下调蛋白有:LAMB1、HNRNPH3、COX2等,上调蛋白有:EPPK1、ITPR1、AKR1C2等。最显著的下调GO为磷酸化修饰功能,上调GO为细胞骨架功能,最显著的下调KEGG通路为半乳糖代谢通路,上调KEGG通路为肌动蛋白细胞骨架调节通路。共检测到含WD40 repeat结构域(WD40 repeat)等20个蛋白结构域。rLV组和rLV-TUC338组中有显著差异的结构域包括Haem peroxidase,animal等。主要亚细胞成分及主要差异亚细胞成分均为核蛋白,分别占34.23%、24.22%。rLV组和rLVTUC338组中下调的互作网主要包括:prot1(P37268)-prot2(O95864)、prot1(Q6FGH9)-prot2(Q13363)等。上调的互作网主要包括:prot1(P60520)-prot2(A0A024RBQ5)、prot1(P60520)-prot2(Q06330)等。结论Lnc RNA TUC338影响了人类宫颈癌细胞的蛋白组学,是宫颈癌的抑癌基因,并通过糖代谢、磷酸化、细胞骨架这3个通路抑制肿瘤发展。