基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS鉴定棒状杆菌和类棒状菌群效能分析

摘要

目的 通过与API Coryne法比较,分析基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定棒状杆菌和类棒状菌群的效能.方法 收集分离自50例患者临床样本的129株棒状杆菌和类棒状菌群分离株,通过基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS进行棒状杆菌和类棒状菌群鉴定,并以截断分数(种水平≥1.7,属水平≥1.5,无鉴定结果<1.5)为标准进行菌种的二次鉴定,同时采用API Coryne法鉴定,并对菌株16S Rrna基因的前500 bp进行测序,确定各分离株的种类.结果 129株菌株16S Rrna基因的测序结果显示:95株为棒状杆菌,来源于13个物种;34株为类棒状菌群,来源于15个属.MALDI-TOF MS进行菌种鉴定时,以截断分数为标准,100％的棒状杆菌可被鉴定到属水平,98.9％的棒状杆菌可被鉴定到种水平;94.1％的类棒状菌群可被鉴定到属水平,88.2％的类棒状菌群可被鉴定到种水平.而API Coryne法能够鉴定84.2％的棒状杆菌至种水平,61.8％的类棒状菌群至属水平.结论 相较于API Coryne法,基于靶板甲酸直接提取法的MALDI-TOF MS在鉴定棒状杆菌和类棒状菌群时效能更佳.