SHOXa蛋白的生物信息分析及适应性进化研究

摘要

cqvip:目的对SHOX基因进行生物信息学及适应性进化分析,获得氨基酸的基本结构特征和理化性质,研究正选择位点。方法以人SHOXa蛋白序列为模板,应用相关的生物软件进行理化性状、空间结构研究,利用PAML程序检测其SHOXa基因的适应性进化。结果人SHOXa蛋白为292个氨基酸,不具备跨膜结构和信号位点,但有多个磷酸化位点。该蛋白与其他灵长类动物SHOX基因具有较高的同源性,适应性进化分析未发现显著正选择位点,但发现1个潜在的正选择位点(20G)。结论通过对SHOX基因的系统分析,研究其进化特点,为各类矮身材的机制研究提供参考。