基于网络药理学探讨半夏治疗直肠癌的作用机制

摘要

[目的]分析半夏的有效活性化合物及其对直肠癌靶点的作用机制.[方法]应用中药系统药理数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出半夏中的潜在化学活性物质及相关靶点蛋白,采用基因组注释数据库平台(genome annotation database platform,Gene Cards)预测直肠癌的作用靶点,并运用Uniprot数据库查询与之相对应的基因名称,借助Cytoscape 3.7.2软件,构建"药物-疾病-靶点"的网络图,通过String数据库平台构建蛋白间相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,再利用Bioconductor平台和R语言(The R programming language)进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.[结果]通过筛选,共获得半夏的有效化学成分13个,与直肠癌相关的关键化学成分10个,半夏-直肠癌的共同靶点32个,获得15个PPI核心基因;获得GO生物学过程66条和KEGG相关信号通路104条,涉及乙肝通路、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染通路、小细胞肺癌通路、细胞凋亡通路、麻疹通路、人类免疫缺陷病毒1感染通路、大肠癌通路、EB病毒感染通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、p53信号通路、铂剂耐药通路、白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、前列腺癌通路等.[结论]半夏可以通过多种途径对直肠癌产生疗效,此为未来提取半夏治疗直肠癌的有效成分奠定了基础.