华重楼根茎内生细菌群落多样性及其功能预测

摘要

内生菌广泛存在于植物组织内部,是植物微生态系统的重要组成部分.为了解华重楼根茎内生细菌的群落组成和其潜在的生物学功能,采用高通量16S rRNA测序技术分析了2年生华重楼根茎内生细菌群落多样性,并通过PICRUSt分析,评价了其内生细菌的潜在功能.结果表明,5个华重楼根茎共获得112267条16S rRNA V3-V4区高质量序列片段,内生细菌群落的α-多样性Chao1指数、Observed species指数、PD whole tree指数和Shannon指数的平均值分别为3417.7、748.0、40.7和8.3;其优势门为厚壁菌门和放线菌门,优势变形菌纲为γ-变形菌纲和α-变形菌纲,优势菌属为Dubosiella(占比为5.61％).16S rRNA功能预测结果显示,华重楼根茎内生细菌功能主要涉及膜运输、 能量代谢、 碳水化合物代谢、 氨基酸代谢和辅酶因子、 维生素代谢等.华重楼根茎内生细菌群落多样性丰富,具有大量代谢相关的有益菌.