肺鳞癌中miR-144靶基因预测及其生物信息学分析

摘要

目的:分析miR-144靶基因在肺鳞癌中参与的信号通路生物过程.方法:分析TheCancerGenomeAtlas网站中肺鳞癌患者的miR-144的表达量及生存曲线;预测miR-144靶基因并通过表达数据筛选影响肺鳞癌进展基因;BinGo软件对候选靶基因进行GO注释分析,利用DAVID网站预测其信号通路.结果:miR-144表达量高有利于延长肺鳞癌患者生存时间.综合4个靶基因数据库发现miR-144有72个预测结果,其中45个在肺鳞癌患者癌与癌旁组织间表达存在差异.其中部分候选靶基因参与胞核及星形微管的组成,参与上皮细胞增生、RNA合成.通路分析显示部分候选靶基因参与Ras、Wnt、Hippo等信号通路.结论:45个miR-144候选靶基因通过多条信号通路及生物过程调节细胞生命活动,影响肿瘤患者生存预期.