hsa-miR-216a-5p的靶基因及调控网络的生物信息学分析

摘要

利用miRBase、生物信息工具bioinfo和TargetScan7.2、miRDB、miRDIP和miTarBase四个数据库获取了八个物种的miR-216a-5p成熟序列、表达谱数据和129个靶基因.对靶基因集合进行GO、KEGG分析,结果显示hsa-miR-216a-5p主要富集在转录DNA模板、转录生长因子beta受体信号通路、蛋白稳定化等10个生物过程(P<0.01),泛素蛋白连接酶活性、SMAD蛋白结合、蛋白泛素化等4个分子功能(P<0.01)以及糖尿病、内吞作用、TRF通道的炎性介质调节等5个KEGG通路中(P<0.05).借助构建PPI蛋白互作网络,从129个靶基因中筛选出了PTEN、SIRT1、TGFBR2等10个关键基因.