不同镉积累基因型烟草CAX2基因克隆及序列分析

摘要

【目的】克隆不同镉积累基因型烟草中阳离子转运基因（CAX2）,为研究烟草CAX2基因在镉转运过程中的作用机理提供参考。【方法】根据NCBI中马铃薯的CAX2序列,BLAST烟草EST数据库,设计引物克隆普通烟草（Nicotiana tabacum）K326和黄花烟草（N.rustica）的CAX2基因,使用生物信息学方法进行序列分析。【结果】K326和黄花烟草CAX2基因（分别命名为Nt CAX2和Nr CAX2）编码区长度均为1314 bp,核苷酸序列一致性达98.0%;二者均编码437个氨基酸,仅有5个氨基酸位点存在差异。Nt CAX2和Nr CAX2蛋白同源性为98.9%,均有两个完全相同的Na＋-Ca2＋交换蛋白结构域,分别位于CAX2 102-249 aa和293-426 aa区域,具有CAX家族共有的结构特征。Nt CAX2和Nr CAX2理论等电点分别为5.54和5.45,均有较强疏水性,包含11个跨膜结构域和两个重复区域α-1、α-2,三级结构以α-螺旋为主。系统进化分析结果表明,Nt CAX2和Nr CAX2与马铃薯（St CAX2）的亲缘关系最近,蛋白同源性均高于92.0%。【结论】K326和黄花烟草CAX2基因同源性较高,CAX2基因在茄科具有较高保守性。