基于共表达网络挖掘不同前列腺特异抗原水平下的前列腺癌发展相关基因

摘要

目的 采用权重基因共表达网络分析方法 (WGCNA)挖掘不同前列腺特异抗原(PSA)水平下的前列腺癌发展枢纽基因.方法数据来自NCBI的GEO数据库中下载不同PSA水平下的前列腺癌全基因组表达数据集,经过数据预处理后,用WGCNA构建基因共表达网络,识别不同PSA水平下的前列腺癌发展模块与枢纽基因.结果 筛选出的差异基因聚集成一个模块,并且找到10个枢纽基因.结论 结合文献发现,SNAI2、TRIM29、LAMB3、CYP3A5和SLC14A1这5个基因很可能影响不同PSA水平下前列腺癌的发展.