乙脑病毒CN株PrM/E基因的克隆及序列分析

摘要

通过RT-PCR扩增乙型脑炎病毒CN株主要抗原基因PrM/E,并将PrM/E基因克隆、测序后,与Genban K发表的JEV SA14(U14163)基因序列进行比较分析,发现CN株与JEV SA14强毒株的同源性为98%.在JEV基因组5′端477～2477的长2000nt的决定JEV抗原性的PrM/E区中,CN株与SA14株有40个碱基不同,其中28个碱基突变为同义突变,另外12个为错义突变,导致相应的氨基酸序列(666个)中的4个氨基酸发生了突变,其中有2个氨基酸出现在含有关键的抗原决定簇的E蛋白内,但不影响其功能表达.