新疆石河子地区牛病毒性腹泻病毒的分子流行病学调查

摘要

根据GenBank中公布的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)5'UTR保守区基因序列,设计3对引物,应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测方法对采自石河子地区3个场的64份牛全血样品进行核酸检测及测序.结果表明:BVDV阳性率为39.06%(25/64),其中有22对母子对应样品,母牛阳性率为40.91%,犊牛为45.45%,提示新疆石河子地区BVDV垂直感染较严重.9头牛表现临床症状,阳性率为22%,其余为临床健康牛,阳性率为41.81%,数据显示新疆石河子地区奶牛BVDV隐性感染严重.测序得到2条不同的序列,经5'UTR区域核酸序列同源性比较和系统发生分析表明2株病毒与VEDEVAC(匈牙利弱毒疫苗株)亲缘关系最近,同源性达96.2%-100%,用DNASTAR软件进行基因与系统发生进化关系分析属于BVDV-1b基因亚型,未检测到BVDV-2型病毒.提示新疆石河子地区BVDV流行株为BVDV-1b亚型,且经生物型鉴定,所测阳性样品为非致细胞病变型.本研究可为今后的流行病学研究和疫苗应用等防制措施提供依据.