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新疆地区妇女宫颈感染人乳头瘤病毒16型E1、E2的遗传变异分析

             

摘要

目的新疆是宫颈癌高发的地区之一,人乳头瘤病毒的基因变异可能会增加其感染人体的风险并增强该病毒介导的免疫逃逸能力,HPV(Human Papillomavirus)16 E1、E2是病毒在转录及复制过程中的重要蛋白质,E1、E2核苷酸位点的突变可能导致蛋白质的改变,从而影响宫颈癌的发生发展。方法收集80例HPV16感染阳性宫颈粘液样本,提取DNA后进行PCR扩增,将纯化后的PCR产物进行一代测序,并对E1、E2基因进行进化学分析,了解HPV16在新疆地区的基因多态性,统计病理信息分析相关突变位点与宫颈癌的进展关系。结果80个HPV16阳性样本中,E1发生突变的样本有34个,发生核苷酸突变的位点有25个,(11个错义突变,14个同义突变)。HPV16 E2发生突变的样本有53个,发生核苷酸突变的位点有14个,(11个错义突变,3个同义突变)。在HPV16 E1上常见的核苷酸突变位点为A978G(14/80)、G1473A(10/80)所对应的氨基酸改变为I326M、M491I,在HPV16 E2上常见的核苷酸突变位点为C2295A(14/80)、C2546T(20/80),所对应的氨基酸改变为T135K、P219S。结论由系统发育树结果可看出有77个样本属于欧洲株,3个样本属于亚洲株。没有发现非洲株和北美/亚裔株。

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