紫苏PfPDCT基因序列特征及表达分析

摘要

采用生物信息学技术和在线分析软件对紫苏PfPDCT基因序列及所编码的蛋白质进行分析,并且利用实时荧光定量PCR技术研究该基因在晋紫苏1号种子发育不同时期的表达特性,旨在探究磷脂酰胆碱甘油二脂转磷酸胆碱酶(PDCT)在植物脂肪酸代谢过程的作用.结果 表明,紫苏PfPDCT基因cDNA全长序列为2 098 bp,开放阅读框为1 683 bp,编码560个氨基酸残基.生物信息学分析结果表明,PfPDCT蛋白分子量约为59.315 ku,等电点为9.48,不稳定系数为35.00,推测其为稳定蛋白,与已知赤藓PDCT蛋白高度同源.通过荧光定量PCR分析可知,紫苏PfPDCT基因在不同发育时期的种子中均有表达,其中,在开花后20 d表达量最高,为开花后10d的1.92倍.研究结果可为进一步阐明紫苏PPDCT基因的功能及作用机制奠定基础.