孔雀与鹌鹑MC1R基因片段的鉴定及序列分析

摘要

探讨了孔雀、鹌鹑黑素皮质素受体1(melanocortin 1-receptor,MC1R)基因序列与禽类羽色的相关性.根据GenBank上原鸡的MC1R基因序列,利用在线引物设计软件Primer3在编码区设计引物PE.以孔雀和鹌鹑DNA为模板进行PCR扩增及测序,分别获得长度约为350 bp的基因片段.经比对发现,孔雀与原鸡的相似性为95.47％,有16处突变,3处缺失;鹌鹑与原鸡的相似性为97.70％,有8处突变,1处缺失.对其氨基酸序列进行蛋白质二级结构预测,结果显示,孔雀与鹌鹑α螺旋、β折叠、无规则卷曲所占比例分别为59.48％,2.59％,37.93％和58.62％,1.82％,39.66％.表明MC1R基因可能是表达禽类羽色的主效基因.