桑青枯雷尔氏菌gsp C和gsp M基因的获取与序列分析

摘要

Ⅱ型分泌系统广泛存在于革兰氏阴性细菌中,转膜蛋白基因簇是其分泌途径的中心.利用PCR扩增和测序,获得了桑青枯雷尔氏菌MR111的gspC基因707 bp和gspM基因575 bp的序列,SMART软件预测gspC基因编码的7～29位氨基酸为跨膜结构域,羧基末端无PDZ结构,gspM的胞质结构域有2个α螺旋和4个β折叠.使用gspC和gspM的保守序列组成的联合矩阵构建系统发育树,结果表明,桑青枯雷尔氏菌MR111与罗尔斯顿氏菌和雷尔氏菌属优先聚合在同一分支,伯克氏菌和伯克霍尔氏菌位于较远分支.