阿尔茨海默病引起的轻度认知功能损害的微小RNA表达谱的生物信息学分析

摘要

目的·分析阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)所致轻度认知功能损害(mild cognitive impairment,MCI)患者的血浆微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱,并探讨AD所致MCI在遗传调控水平上的发病机制。方法·纳入5例AD所致MCI患者和5例对照受试者,应用miRNA芯片测序技术分析血浆miRNA表达谱。采用TargetScan 7.2数据库分析显著上调miRNA的靶基因。采用Cytoscape软件分析显著上调miRNA的miRNA-基因相互作用网络,筛选关键miRNA。运用R语言对关键miRNA的靶基因进行基因本体数据库(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果·AD所致MCI患者的血浆中存在13个显著上调的miRNA,其中有5个是核心调控网络中的关键miRNA,其靶标基因主要参与突触可塑性调节、Wnt信号通路、突触间囊泡转运和突触间囊泡定位等生物学过程,并调控Ras信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和糖酵解/糖异生等通路。结论·AD所致MCI患者血浆中5个上调的miRNA可能作为关键调控因素参与AD相关的病理进程,或可成为诊断AD所致MCI的潜在生物学标志物。