百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析

摘要

采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法获得百子莲生长素受体TIR1基因cDNA全长序列,对该序列进行生物信息学分析的结果显示,TIR1基因的mRNA序列全长为2 235 bp;5'非编码区296 bp,3’非编码区172 bp;该基因的ORF全长为1 764bp,编码一个含有588个氨基酸的蛋白.百子莲TIR1推导蛋白序列与葡萄(Vitis vini era)、二穗短柄草(Brach ypodium distach yon)、高粱(Sorghum bicolor),玉米(Zeamays)等植物均具有较高的同源性,同源性最高的是葡萄,可达78％.系统进化树表明,百子莲与葡萄距离最近.由α-螺旋,随机卷曲和延伸链组成一个磁状结构,为亲水蛋白,疏水性值为-0.092,在百子莲体细胞胚胎发生过程中,实时荧光定量PCR结果表明TIR1基因表达量在愈伤组织中含量最低,在胚性愈伤组织和体细胞胚胎中含量均有所升高,而在体胚幼苗中表达量最高,表明该基因介导的生长素信号在体细胞胚胎发生过程中发挥着非常重要的作用.