分子对接法研究1-甲基芘及其含氧代谢物与BSA的相互作用

摘要

应用分子对接法研究了1-甲基芘(1-MPyr)及其含氧代谢物1-羟甲基芘(1-OHMP)和1-芘甲酸(1-PCA)与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用.结果表明:3种小分子与BSA的亲和能力的强弱顺序为1-OHMP＜1-MPyr＜1-PCA;1-MPyr结合在BSA的ⅡA域和ⅢA域之间,而1-OHMP和1-PCA均结合在BSA的IB域;结合位点周围与1-MPyr、1-OHMP和1-PCA产生相互作用的主要氨基酸残基数目分别为6、5和6;1-MPyr与BSA主要靠疏水作用力结合,而1-OHMP及1-PCA与BSA的结合作用力主要为疏水作用力和静电作用力,且1-PCA还与Leu115残基形成了键长为0.21 nm的氢键.