青海省大麦黄矮病毒GPV株系小麦分离物基因组克隆及序列特征分析

摘要

为有效防控大麦黄矮病毒(barley yellow dwarf virus,BYDV)病,于2019年自青海省循化县小麦田采集疑似感病病叶,并对其进行反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)检测,并克隆得到BYDV-GPV株系全基因组序列,对克隆的全基因组序列进行系统发育树分析和碱基突变分析。结果显示,在采集样品中检测到BYDV-GPV株系,克隆得到了BYDV-GPV小麦分离物基因组,其序列全长为5676 bp,包含3个非编码区和6个开放阅读框,编码6个蛋白,与BYDV-GPV核苷酸序列的一致性高达98.17%,并聚在一个分支上,表明该分离物为BYDV-GPV。获得的青海BYDV-GPV序列在3′UTR出现碱基突变,多了4个碱基。