基于Hurst指数的DNA序列相似性分析

摘要

[目的]建立直接将Hurst指数作为指标参数进行DNA序列相似性分析的方法.[方法]以11个物种β-球蛋白第一个外显子的编码序列作为分析对象,首先将DNA序列转化为数字序列,然后用重标极差分析法计算各编码序列的全序列Hurst指数,之后利用它们的Hurst指数构建距离矩阵进行相似性分析,并将建立的基于Hurst指数的DNA序列相似性分析方法与其他方法的分析结果进行比较.[结果]建立的基于Hurst指数的DNA序列相似性分析方法,较好地从相关性角度反映了分析序列的生物特性指标,具有较好的相似性分析效能.与其他方法相比,该方法分析结果的敏感性较高,有助于提高进化距离较近的分析对象间的区别度.[结论]Hurst指数可以作为指标参数描述DNA序列的相似性,可将其进一步应用于生物序列的信息分析.