5株PCV2四川株全基因组的克隆与遗传进化分析

摘要

[目的] 了解目前四川省猪圆环病毒2型（PCV2）的分子流行病学特征和遗传变异情况,探讨PCV2感染的控制对策。[方法] 根据GenBank中发表的PCV2基因组序列设计2对特异性引物,对2012-2014年临床送检的PCV2感染病例材料中的5株PCV2全基因组序列进行扩增测序,并利用DNAStar等生物信息分析软件对获得的PCV2基因组序列进行分子特性与遗传演变分析。[结果] 5株PCV2四川株全基因组序列长度都为1 767bp,均具有滚环复制起点（ORC）典型结构。序列比对和进化分析显示,5株PCV2四川株的基因序列同源性很高,基因组核苷酸序列及ORF1、ORF2和ORF3基因序列同源性分别为98.4%～99.9%,97.5%～99.6%,99.4%～100%和96.2%～100%,ORF1、ORF2和ORF3基因推导氨基酸序列同源性分别为98.4%～99%,99.6%和91.5%～100%;与47条参比PCV2毒株核苷酸序列的同源性比较发现,5株PCV2与国内一些新出现的PCV2毒株亲缘关系较近,且均属于PCV2d基因型毒株。[结论] 5株PCV2四川株之间尽管存在着不同程度的基因变异,但遗传进化相对较稳定。