桉树焦枯病菌SIT转运蛋白的鉴定与表达

摘要

[目的]揭示SIT转运蛋白家族在焦枯病菌铁元素摄入机制,以及铁载体-铁转运蛋白在焦枯病菌侵染桉树过程中所扮演的角色.[方法]采用HMMER软件对焦枯病菌SIT转运蛋白进行鉴定,并用InterPro、TM-HMM、TCDB数据库等的在线服务对焦枯病菌SIT转运蛋白的结构域、跨膜螺旋和功能进行预测,用MEGA7.0软件进行多菌种比较分析,最后采用qPCR对焦枯病菌侵染桉树48 h时SIT基因的转录表达情况进行验证.[结果]桉树焦枯病菌共含有16个SIT转运蛋白,约占总编码蛋白的0.11％,主要分为铁-铁载体转运蛋白、铁载体-铁:H+同向转运蛋白和铁载体-铁转运蛋白;亚细胞定位预测结果显示,除预测CpSit13转运蛋白位于内质网上外,其余均在细胞膜上.桉树焦枯病菌SIT转运蛋白的序列长度为400～603 aa,其结构域均为MFS结构域,跨膜螺旋为10～14个.基因表达谱分析显示,有10个SIT基因上调表达,有2个下调表达,有4个表达不显著.其中CpSit1、CpSit5、Cp-Sit8、CpSit14和CpSit16相对分支中其他基因具有较高的转录量.qPCR验证结果与基因表达谱具有较高的一致性.[结论]CpSit1、CpSit5、CpSit8、CpSit14和CpSit16基因在焦枯病菌侵染桉树过程中具有较为重要的作用.