基于差异共表达分析的肝癌特异性基因的筛选与验证

摘要

结合一种新颖的差异共表达分析方法,应用生物信息学工具,在多个肝组织数据集中获取与肝癌相关的基因模块和枢纽基因(Hub gene).传统的差异表达分析方法只关注平均表达水平的差异,忽略了基因共同表达的信息.与传统差异表达分析方法相比,本方法可以有效地从基因相互作用角度识别出肝癌的关键基因.关键基因主要参与了p53、细胞周期、癌症和Wnt等重要的信号通路,其中HDAC1、APOB、UBE2 D1、SOCS1和ELAVL1基因既没有显著的差异表达,也没有参与重要的癌症通路,但经鉴定这些基因与肝癌的发生和发展密切相关.生存曲线分析表明,有7个基因差异表达使得肝癌患者总体生存率显著降低(p<0.01).这些结果可以作为差异表达分析研究结论的补充,为肝癌的诊断和治疗靶点选择及预后判断提供参考.