EGFR-TKI获得性耐药相关基因标志物筛选及其对肺腺癌预后预测的价值

摘要

目的:寻找有效的表皮生长因子酪氨酸激酶受体抑制剂(epidermal growth factor receptor-tyosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)获得性耐药相关基因标志物,用于肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)的预后预测。方法:通过单因素和多因素Cox比例风险回归分析筛选出EGFR-TKI获得性耐药相关基因标志物,并构建LUAD预后风险评分模型。采用基因本体论(gene ontology,GO)进行功能注释。结果:筛选出EGFR-TKI获得性耐药相关基因MYO1D、PCDH7、TNFSF15、COL4A6、BEX2、WFDC21P、CADPS2作为LUAD预后的基因标志物,并基于标志基因构建了LUAD预后风险评分模型。针对建立的风险评分模型,通过Keplan-Meier生存曲线和受试者工作特征曲线分析可知,训练组中高风险患者5年生存率(37.8%)明显低于低风险患者(71.5%)(P<0.001),且受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)为0.743,验证组中高风险患者5年生存率(25.6%)明显低于低风险患者(49.8%)(P<0.001),其AUC为0.719,说明构建的风险评分模型具有较好的预测能力。同时,将风险评分与其他临床信息进行Cox比例风险回归分析表明风险评分为独立预测指标,进一步说明筛选出的基因标志物为独立预后因子。GO功能注释显示,筛选出的标志基因可能从调控肌动蛋白、细胞外基质、凋亡等方面调控LUAD预后。结论:筛选出的EGFR-TKI获得性耐药相关基因标志物为独立预后因子并可能成为LUAD的潜在治疗靶点。