一株急性散发性戊型肝炎病毒基因结构及核苷酸同源性分析

摘要

目的:分析一株长春地区散发戊型肝炎病毒(HEV)的基因结构和核苷酸同源性.方法:采用RT-nPCR方法检测HEV RNA,应用全自动测序仪进行序列测定.结果:所获得的HEV-CCC220全长7 193bp,编码2 397个氨基酸,由5′-UTR(nt 1-9)、3′-UTR(nt 7152-7193)和3个开放读码框架(ORFS)组成.与HEV Ⅳ型核苷酸同源性明显高于HEVⅠ～Ⅲ型,全基因序列核苷酸同源性为83.2 %～85.0%;与ORF2间300 nt和98 nt部分基因序列核苷酸同源性分别为85.0%～93.9%和80.6%～86.7%.结论:长春地区散发性HEV-CCC220属HEV Ⅳ型,ORF2间300nt部分核苷酸序列可以代替全基因序列进行HEV基因型分析.