北京地区急性散发性戊型肝炎中戊型肝炎病毒基因型及亚型分布

摘要

为了解北京地区急性散发性戊型肝炎患者感染的戊型肝炎病毒(HEV)基因型和亚型分布，本文采用实时荧光PCR的方法检测93例急性散发性戊型肝炎患者粪便标本，并对阳性粪便标本应用RT-PCR方法扩增HEV RNA开放读码框架2(ORF2)部分序列，进行克隆测序，利用生物信息学软件进行基因型和亚型分析。结果显示，93例急性戊型肝炎患者粪便标本经实时荧光PCR方法检测52份阳性(55.91%)。RT-PCR获得的41个克隆核苷酸序列同源性为83.3%～100%，与Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型HEV参考序列的同源性分别为77%～80.5%，78.6%～81.2%，76.7%～81%，83.3%～93.7%，41例均属于基因Ⅳ型。进化树分析提示41例可能属于3个基因亚型，6例为Ⅳa亚型，34例属Ⅳb亚型，另外1例(ya30)属于Ⅳ型，但单独形成一个亚型分支，可能为一个新的亚型。提示北京地区的急性散发性戊型肝炎中HEV属于Ⅳ型，但可能有不同的基因亚型。