基因序列分析鉴定犬冠状病毒分离株

摘要

采用双脱氧末端终止法测定了克隆于重组质粒YS1pUC、CI1pUC上的2株国内分离病毒CCv YS1、CI1部分纤突蛋白基因序列,以计算机软件推导氨基酸序列,进行核苷酸和氨基酸序列的多重比较,绘制系统进化树,分析重要抗原位点氨基酸残基的变化情况,预测蛋白质疏水性和二级结构.结果表明:重组质粒中含有571 bp的外源基因,核苷酸和氨基酸序列与国外发表的K378等5株CCv相应序列的同源性分别为91.7%～99.4%和92.0%～99.4%,而与猪传染性胃肠炎病毒PUR46株和猫传染性腹膜炎病毒1146株的同源性为90.2%和88.0%～90.0%.A抗原的Ab亚位点上的氨基酸残基与各株CCV相同,不同于其他冠状病毒.由此进一步证明,2株国内分离病毒CCV YS1、CI1为犬冠状病毒.