水貂IGF-1R基因SNPs筛查及其与生长性状的关联分析

摘要

为分析IGF-1R基因部分SNPs与银蓝水貂与美国短毛黑水貂2个群体生长性状的关联性.以同龄同场的银蓝水貂和美国短毛黑水貂为研究对象,采用PCR产物直接测序法筛查IGF-1R基因CDS序列的多态位点,利用SPSS(19.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型与水貂生长性状的相关性.在线软件对IGF-1R基因进行生物信息学分析.结果表明:在IGF-1R基因外显子2和外显子8分别检测到G207A同义突变和G1782A同义突变,根据测序峰图对2位点进行基因分型.群体遗传学分析显示,G207A位点在银蓝水貂群体中属于低度多态,G1782A位点在银蓝水貂群体中属于中度多态,G207A和G1782A 2个位点在美国短毛黑水貂中均为中度多态;x2检验表明,银蓝水貂和美国短毛黑水貂群体在2个突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05);关联分析表明,G1782A位点与美国短毛黑水貂的体重显著相关(P＜0.05),突变纯合子AA基因型个体的体重值显著高于GG基因型个体和GA基因型个体.因此G1782A位点适合于短毛黑水貂体重的分子标记选择.