用主链局域结构关联特征识别疟原虫分泌蛋白

摘要

应用生物信息学方法识别疟原虫分泌蛋白和非分泌蛋白,为了提供快速的抗疟疾药物和疫苗的设计药物靶标筛选手段,采用径向核函数支持向量机进行疟原虫分泌蛋白和非分泌蛋白的分类识别.Jackknife检验结果表明,敏感性为85%,特异性为90%,总精度为88%.与现有的其它模型相比,在保证较高识别精度的前提下,大幅降低了模型所使用的特征数,增强了识别模型的鲁棒性.构建精度高且鲁棒性好的药物靶标蛋白质生物信息学识别模型,一方面可以为理解蛋白质功能机制提供有价值的线索,另一方面可作为针对病源蛋白进行药物和疫苗设计的快速筛查手段.