数据挖掘鉴定PRIM1与肝细胞癌不良预后相关

摘要

对DNA引物酶亚基1(DNA primase polypeptide 1,PRIM1)与肝细胞癌(Liver Hepatocellular Carcinoma,LIHC)不良预后的相关性进行生物信息学研究。作为关键的酶促成分,PRIM1对DNA的合成至关重要。在TIMER数据库中发现,PRIM1在多种癌症中失调,且在LIHC中显著上调,提示其可能参与人类癌症发生发展进程。基因表达综合数据库的LIHC相关数据集以及细胞系和组织证实了PRIM1高表达。经对UALCAN数据库亚组分析,不同种族和亚型的LIHC患者中PRIM1的表达均上调,可辅助判断患者临床病例特征。从cBioPortal数据库中发现PRIM1出现基因组改变,包括拷贝数扩增和意义不明的错义突变和截断突变可能与LIHC发展有关。对PRIM1共表达基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析,结果揭示了其涉及的生物学过程和功能。通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析PRIM1的预后价值表明,高PRIM1表达与LIHC不良预后显著相关。数据挖掘揭示了PRIM1在LIHC中表达和突变的数据,且与LIHC不良预后相关。