腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育

摘要

为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个种群中,DEll、DEly、DEAY987007三个种群(Ⅰ组)内部之间的碱基差异在1%以内,其它的5个种群(Ⅱ组)之间的差异为0～1%,而Ⅰ组与Ⅱ组种群之间的差异达到了15%(根据ITS1+5.8s+ITS2序列)或20%(根据ITS1+ITS2序列).这说明我国腐烂茎线虫很可能是1个复合种.根据ITS区核酸序列构建的系统发育图同样显示,我国腐烂茎线虫的7个地理种群明显分为2个分支A和B.