海南短指软珊瑚msh1基因的系统进化

摘要

cqvip:为了在分子水平上对海南短指软珊瑚进行分类与鉴定,以海南15份短指软珊瑚(Sinularia)与结合 Genbank 种搜索到的Sinularia种msh1基因序列进行系统进化树构建分析.结果在msh1碱基比对中发现,所有海南样品与澎湖指形软珊瑚(S.penghuensis)、西沙短指软珊瑚(S.notanda)和南海圆形短指软珊瑚(S.brassica)亲缘关系较远.在已知种中,可以得出西沙短指软珊瑚(S.notanda)种分化时间最早.样本 S126 msh1和S.polydactyla序列相同,则为多型短指软珊瑚(S.polydactyla);样本 S121 msh1和S.cruciata序列相同,则为台湾海域软珊瑚(S.cruciata);样本S088 msh1与S.verseveldti序列相同,则为S.verseveldti;样本 S193 msh1与S.flexibilis序列相同,则为弱软短指软珊瑚(S.flexibilis);样本 S035 msh1与S.abrupta(JX991168.1)序列相同,则为S.abrupta.样本 S053 msh1和S.crassa与S.finitima亲缘关系相近;样本 S010 msh1、 S118 msh1、 S168 msh1、 S100 msh1、 S031 msh1和S.abrubta( FJ621374.1)与西沙短指软珊瑚(S.molesta)和思氏指形软珊瑚(S.slieringsi)亲缘关系最近,因此这些海南样本都为Sinularia.sp.