海南肉芝软珊瑚msh1基因的系统进化

摘要

为了在分子水平上对软珊瑚进行分类和鉴定,以海南32份肉芝软珊瑚(Sarcophyton)与目前已知的Sarcophyton种msh 1基因序列进行系统进化树构建.结果在 msh 1碱基比对中发现,海南样本msh-11在序列717位置缺失单碱基;样本msh-50在序列632和652位置插入单碱基T;其余样品未见碱基插入和缺失.在所有已知 Sarcophyton种中,Sarcophyton pauciplicatum和Sarcophyton buitendijki 2个种分化时间最早;有6组其每组内Sarcophyton种msh1序列一致;海南样本msh-5与 Sarcophyton cinereum和Sarcophyton crassocaule 序列相同;样本Msh-6与 Sarcophyton cherbonnieri 亲缘关系最近.样本msh-21和msh-17与 Sarcophyton buitendijki 亲缘关系最近.样本msh-44与 Sarcophyton boettgeri 亲缘关系最近;样本msh-30和样本msh-38与Sarcophyton ehrenbergi亲缘关系最近;其中样本msh-8、msh-7、msh-12、msh-5、 msh-9和msh- 40与其他 Sarcophyton 种亲缘关系较远.