2012—2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

摘要

目的:研究广西HIV-1独特重组型毒株(URFs)的基因重组特点,为广西HIV-1疫情防控提供科学依据。方法:对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序,从PubMed等数据库检索2012—2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列,构建系统进化树,并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析。结果:测序获得1例长度约8.9 kb的URF,该URF是以CRF08_BC为骨架插入CRF01_AE片段构成的二代重组毒株。将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析,发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者。所有URFs均包含CRF01_AE片段,以01_AE/07_BC重组比例最高(69.2%,9/13),1例URF含有主要耐药位点。结论:广西已鉴定的URFs数量较少,以01_AE/07_BC重组为主,应加强对URFs的监测和鉴定,以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点。