广西首例HIV-1G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

摘要

在我国广西地区收集1例感染了HIV-1毒株的病人外周血血浆，提取病毒RNA，利用逆转录巢式-PCR技术，分两段扩增病毒近似全长基因序列，对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析，获得了8800bp长度的近似全长序列，利用MEGA软件进行系统进化分析，结果显示该毒株为G亚型毒株，系统发育分析结果显示该毒株与G亚型参考株成簇，Bootstrap值较高(99％);通过与世界上其他地区流行的G亚型毒株进行亲缘分析，发现该毒株与喀麦隆流行毒株关系较近，提示该毒株可能是由境外传入。这是广西地区发现的首例HIV-1G亚型毒株，也是国内报道的首例G亚型近似全长基因序列，该序列的测定和分析对于广西地区流行毒株监测具有重要意义。