登革病毒模拟ADE效应中肝细胞lncRNA的差异表达

摘要

目的分析登革病毒(DENV)感染L-02细胞中长链非编码RNA(lncRNA)差异表达。方法利用DENV1 NS1抗体和DENV2孵育后感染L-02细胞模拟抗体依赖性感染增强效应(ADE),转录组测序(RNA-Seq)后分析lncRNA表达谱,生物信息学探讨差异表达lncRNA潜在靶基因、miRNA前体预测并利用实时荧光定量PCR(RTqPCR)验证差异表达结果。结果在ADE中得到36个高表达和39个低表达lncRNA,其中n344659潜在靶标基因(ID:10236)具有miRNA前体处理功能;n344462为hsa-let-7a-1和hsa-let-7f-1前体,分别具有肿瘤活性抑制因子作用和抑制Bcl-xL基因表达作用。RT-qPCR显示7个高表达和4个低表达lncRNA(P<0.05)。结论ADE中差异表达lncRNA可能具有重要生物学功能。