鸡MHC-B区域内复合微卫星LEI0258位点等位基因的序列变异

摘要

在对15个样品鸡MHC-B区域内复合微卫星位点LEI0258的等位基因进行基因型分析的基础上,进一步开展了等位基因PCR产物的直接测序或克隆测序,并将获得的序列与GenBank中的18条同源序列作了比较.结果表明:LEI0258位点等位基因片段大小分别为247 bp、249 bp、307 bp、357 bp、369 bp、381 bp、393 bp或443 bp的等位基因具有不同的DNA序列或结构;上、下游共有3个in/dels和7个SNPs;由12 bp和13 bp组成的重复单元中也存在一定的变异,其中,HRJ23中一个13 bp的重复单元由标准的"CTATGTCTTCTTT"变为"CTATATCTTCTTT",HRJ5和JT01中各有一个12 bp的重复单元由标准的"CTTTCCTTCTTT"变为"CTTCCCTTCTTT",而HRJ5、HRJ15和P22中也各有一个12 bp的重复单元由标准的"CTTTCCTTCTTT"变为"CTTTTCTTCTTT".