三穗鸭ORAI1基因遗传变异与蛋壳品质的相关性

摘要

在NCBI GenBank数据库中获取鸭ORAI1基因组序列,采用Primer 3.0程序设计引物扩增该基因全部编码区,PCR扩增产物纯化后直接测序,采用DNAStar软件中的MegaAlign程序结合测序结果筛查鉴定单核苷酸突变(SNP)位点,并运用SPSS 18.0软件分析SNP位点与蛋壳品质的相关性,旨在探究三穗鸭钙释放激活钙调节蛋白1基因的遗传变异及其与蛋壳品质的相关性,为改善蛋壳品质提供新的科学资料.结果 表明,只在三穗鸭ORAI1基因第3外显子发现3个同义突变位点,分别是g.16789 C>T、g.16984 C>T和g.17074 A>G.相关性分析显示:g.16789 C>T、g.16984 C>T和g.17074 A>G位点对蛋壳强度的影响达到显著水平(PT和g.16984 C>T两个位点CT杂合基因型个体的蛋壳强度显著高于TT纯合基因型,g.17074 A>G位点GG基因型个体的蛋壳强度显著高于AG基因型(P<0.05),揭示CT和GG是有利基因型;3个SNP位点组合基因型对蛋壳强度和厚度均有不同程度的影响,其中,H2H3和H3H3双倍型个体的蛋壳厚度显著高于H2H2型(P<0.05),H3H3型的蛋壳强度显著高于H2H2型(P<0.05).揭示在ORAI1基因第3外显子检测到的3个SNP位点与蛋壳品质具有相关性,可以作为改善鸭蛋壳品质分子标记选育的资料.