利用生物信息学方法预测HAb18G/CD147拮抗肽的性质和功能

摘要

目的 :利用生物信息学方法对HAb1 8G/CD1 4 7拮抗肽 (AP 1～ 9)进行理化性质的预测及相似性的比较 ,为拮抗肽的结构与功能研究提供预测和帮助 .方法 :应用ExPASy数据库分析短肽的Mr、等电点、疏水性等理化性质 .利用Blastp,PDB_ISL和SCOP等数据库对HAb1 8G/CD1 4 7拮抗肽进行相似性比较 .结果 :经ExPASy数据库分析 9条拮抗肽中有 6条呈碱性 ,且大部分呈亲水性 ,半衰期由 1 .3～ 30 .0h不等 .Blastp分析AP 2与血管紧张素转化酶Ⅱ的活性中心部分序列相似 .PDB_ISL分析AP 3,9与NADPH氧化酶部分序列相似 .SCOP分析AP 2与Ras结合蛋白 (RBD) ,CAD结构域及金属蛋白酶催化结构域相似 ;AP 7与环亲和素及微管蛋白C 末端结构域相似 .结论