牙鲆GH基因的SNPs与生长性状关系的初步研究

摘要

以雌核发育牙鲆(Paralichthys olivaceus)为对象,根据GenBank收录的牙鲆生长激素基因序列(GenBank登录号:D29737)设计9对引物,采用直接测序的方法对50尾雌核发育牙鲆生长激素基因编码区和启动子进行了单核苷酸多态位点(SNPs)筛选,共获得有效序列1 838 bp,启动子区117 bp,内含子区1 050 bp,外显子区671 bp,覆盖牙鲆生长激素基因78.3％的序列.共检测到7个SNPs,平均发生频率为0.38/100个碱基,其中颠换型3个,插入型2个,缺失型2个;内含子区4个(Intron Ⅰ:C477T、1 091～1 092/insert T、1 129～1 130/insert A; Intron Ⅳ:1 906A/-del),外显子区3个(ExonⅤ:2067T/-del、A2006C、A1974G); SNPs与生长性状相关分析结果显示:C477T和2 067T/-del两个位点对牙鲆的体重、体长、体高等生长性状均有显著影响(P＜0.05),其他5个SNPs对牙鲆生长性状均无显著影响(P＞0.05).研究结果可为牙鲆生长性状的SNPs标记辅助选育提供基础数据.