代谢相关基因在儿童急性淋巴细胞白血病细胞中的表达及预后价值

摘要

目的:分析代谢相关基因在儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中的表达及预后价值,探索新的预后判断标志物及治疗靶点。方法:以84例B细胞型ALL患儿作为研究对象,对所有样本转录组(RNA-Seq)测序数据中的代谢相关基因进行差异表达分析,利用COX单因素回归及Lasso回归方法构建代谢相关基因预后积分系统,COX多因素回归分析评价积分系统的预后价值,采用GSEA软件进行基因富集分析。结果:从转录组测序结果中共提取933个代谢相关基因的表达量数据进行差异表达分析,31个基因被鉴定为差异表达基因,其中14个基因在复发组表达上调,17个基因在复发组表达下调。进一步筛选出12个基因纳入预后积分系统,其中8个为复发组上调的基因(ASS1、CKM、PTGES、ADCY5、HNMT、PHGDH、CYP4F3、AADAT),4个为复发组下调的基因(GDA、DHRS9、IDO2、UGT2B4)。积分高风险组和低风险组的无复发生存率比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。在纳入性别、年龄、初诊时白细胞计数、细胞及分子遗传学等临床特征后,该预后积分系统风险评分仍为疾病复发独立的危险因素(HR=8.906,95%CI:3.114-25.470)。GSEA结果显示,氨基糖和核苷酸糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、果糖和甘露糖代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、嘧啶代谢、硒氨基酸代谢等通路在高风险组被显著富集。结论:代谢相关基因表达异常与儿童ALL预后相关,这些基因有望成为儿童ALL新的预后判断标志及治疗靶点。