miR-450基因家族进化分析及其在沙子岭猪睾丸组织表达量分析

摘要

为探明miR-450基因家族(miR-450s)的系统进化历程及其在沙子岭猪睾丸组织不同发育时期表达规律.通过miRBase数据库检索miR-450s序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-450s在不同物种中的基因组定位,采用MEGA 6.0构建miR-450基因家族的系统进化树,并利用RT-qPCR检测miR-450s在沙子岭猪睾丸组织不同发育期(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表达变化.miRBase数据库共检索15个物种36条miR-450s序列,且miR-450s序列具有高度保守性.基因组定位显示miR-450s位于X染色体上,均位于基因间隔区(Intergenic region,IGR),且miR-450基因家族成员在进化过程中紧密相连,可能由于串联重复所致.RT-qPCR结果显示,miR-450s在胚胎期中表达量显著高于出生后表达量(P＜0.01),且miR-450基因家族3个成员(miR-450a、miR-450b、miR-450c)在沙子岭猪睾丸不同发育阶段呈现出协同表达的特性.miR-450基因家族可能在猪睾丸组织发育过程中发挥重要调控作用.