miR-221/222基因家族进化分析及其在猪睾丸组织中的表达变化

摘要

运用生物信息学方法在miRBase中搜索动物miR-221/222基因家族的序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-221/222在基因组中的位置,采用MEGA 5.0构建miR-221/222系统进化树;并利用RT-qPCR技术定量检测猪睾丸组织中不同发育时期miR-221/222的表达变化.结果表明:在34种动物中共搜索到59条miR-221/222序列,所有的miR-221/222基因都存在于基因间隔区.进化分析表明,各物种miR-221/222基因家族可能以不同的方式和速度进化而来.RT-qPCR检测结果显示,miR-221/222在猪睾丸组织中不同发育时期表现出相同趋势的表达规律,即出生后其表达水平先升高,生长发育时期降低,随着性成熟又呈现升高趋势.研究结果为深入理解miR-221/222基因家族的作用机制奠定基础,也为后续研究提供参考.