混合并行技术在激光化学反应模拟中的应用

摘要

为提高激光化学反应模拟效率,在半经典分子动力学模拟中引入混合并行技术和双层并行思想.基于MPI+OpenMP混合模型设计并实现激光化学反应双层并行模拟算法,上层基于MPI实现节点间的原子分解并行,下层基于OpenMP实现节点内的多线程矩阵并行乘法.在SMP集群中测试表明,模拟大分子体系激光化学反应并行效率可达60%以上.因此,应用混合并行技术可有效提高激光化学反应模拟效率.