非酒精性脂肪性肝病的异常m6A修饰

摘要

目的:非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)严重影响人们的健康,近来研究发现6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)甲基化参与机体脂质代谢过程,但仍缺乏针对NAFLD的m6A修饰水平的研究.本研究探讨NAFLD患者肝组织中m6A修饰水平的变化.方法:采用液相色谱质谱(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)分析NAFLD患者肝组织中总m6A修饰水平的变化,甲基化RNA免疫共沉淀(methylated RNA immunoprecipitation,MeRIP)和微阵列(包含44122个mRNA和12496个lncRNA)分析整个转录组的m6A修饰水平的变化,进而通过基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析、基因和基因组京都百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析对差异修饰的mRNA进行功能注释,最后随机抽取4个mRNA和4个lncRNA,通过MeRIP及实时反转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)验证微阵列结果.结果:与对照组相比,NAFLD组m6A总修饰水平明显下降,NAFLD组有176个差异修饰的mRNA和44个差异修饰的lncRNA.其中15个mRNA和7个lncRNA m6A修饰水平上调,而161个mRNA和37个lncRNA m6A修饰水平下调;GO功能富集分析和KEGG通路富集分析显示差异修饰的mRNA主要富集于能量代谢、转录调控、翻译调控等生物学过程.结论:与正常肝组织相比,NAFLD患者肝中m6A甲基化修饰发生了显著改变,可能在NAFLD的发生、发展过程中发挥重要作用.