肺癌细胞外泌体GPI-锚定蛋白组学研究

摘要

cqvip:GPI(glycosylphosphatidylinositol)锚定蛋白是一类由蛋白质、脂质和糖链共价结合的复杂糖复合物,参与免疫识别、细胞通讯、信号转导等多种生理过程。外泌体调节包括免疫反应、肿瘤生长等在内的许多病理生理过程,其表面的GPI锚定蛋白具有很大研究价值。为了找到可作为肺癌诊断标记物的GPI锚定蛋白,利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库,从肺癌病人和健康人的mRNA阵列数据中筛选到114种GPI锚定蛋白,其中43种存在显著表达差异。以细胞膜总蛋白为对照,使用DIA(Data Independent Acquisition)定量技术对NCI-H838人非小细胞肺癌细胞外泌体蛋白进行定量分析,共筛选出15个外泌体GPI锚定蛋白。利用NCI-H838细胞外泌体GPI锚定蛋白数据和肺癌病人体内的GPI锚定蛋白数据一起进行筛选,最终获得MSLN (mesothelin)、CPM (carboxypeptidase M)、SMPDL3B (sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B)、HYAL2 (hyaluronoglucosaminidase 2)、EFNA5(ephrin-A5)、RECK(reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs)和GPC1(glypican 1)7种在外泌体高表达,且可作为肺癌诊断标记物的GPI锚定蛋白。