基于生物信息学分析DDX5在头颈部鳞癌中的表达及意义

摘要

目的通过DEAD-box解旋酶5(DDX5)构建信号调控网络,以探讨DDX5在头颈部鳞癌中的表达及临床意义。方法通过芯片技术获得人类mRNA和circRNA的表达谱,筛选出差异表达circRNA和差异表达mRNA。利用Arraystar的microRNA靶点预测软件和OncomiR线上数据库预测circRNA作用miRNA的靶点。再利用Targetscan线数据库预测差异表达miRNA靶向结合的mRNA,与DEGs取交集获得潜在头颈鳞癌中的潜在靶基因。对差异表达mRNA进行功能富集分析,最后利用Cytoscape软件构建circRNA-miRNA-mRNA轴的调控网络。对筛选出的DDX5采用免疫组化、RT-qPCR验证。结果在5对HNSCC及癌旁组织中检测到287个DEcircRNAs和1053个DEGs。通过进行交集筛选,构建一个由2个circRNA、4个miRNA和75个mRNA靶向调控的ceRNA网络,最终发现circRNA-102485-miRNA-103a-2-5p-DDX5轴。DDX5的表达与患者的临床分期(P<0.05)、性别(P<0.05)和肿瘤解剖细分(P<0.05)显著相关。与癌旁组织比较,DDX5在头颈鳞癌组织中主要聚集于细胞质,DDX5在头颈鳞癌组织的表达增加,P<0.05。结论DDX5在头颈鳞癌中的表达相对上调,且在临床分期方面有统计学意义,故其可作为头颈部鳞癌中诊断和治疗的潜在靶点。